Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms