Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms