Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL1Q9NSC2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms