Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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