Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHST12Q9NRB3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms