Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC31BQ9NQW1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms