Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms