Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms