Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms