Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms