Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms