Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms