Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms