Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms