Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms