Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS8Q99627 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS8Q99627 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS8Q99627 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS8Q99627 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS8Q99627 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS8Q99627 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS8Q99627 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS8Q99627 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS8Q99627 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms