Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NAP1L3Q99457 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NAP1L3Q99457 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NAP1L3Q99457 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NAP1L3Q99457 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms