Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MYCBPQ99417 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms