Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRBNQ96SW2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms