Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms