Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT8L2Q96SF2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT8L2Q96SF2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms