Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms