Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms