Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms