Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms