Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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BRF1Q92994 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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BRF1Q92994 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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BRF1Q92994 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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BRF1Q92994 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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BRF1Q92994 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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BRF1Q92994 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BRF1Q92994 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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