Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms