Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29Q8TEQ0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms