Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST4Q8NFU0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms