Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms