Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms