Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT28Q7Z3Y7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT28Q7Z3Y7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms