Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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USP43Q70EL4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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USP43Q70EL4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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USP43Q70EL4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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USP43Q70EL4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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