Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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