Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C9orf139Q6ZV77 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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