Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFCAB12Q6NXP0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms