Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms