Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCSD1Q6JBY9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCSD1Q6JBY9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCSD1Q6JBY9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms