Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPPQ6IPU0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms