Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms