Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SAMD13Q5VXD3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SAMD13Q5VXD3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SAMD13Q5VXD3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SAMD13Q5VXD3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SAMD13Q5VXD3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SAMD13Q5VXD3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SAMD13Q5VXD3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SAMD13Q5VXD3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SAMD13Q5VXD3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SAMD13Q5VXD3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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