Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms