Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms