Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms