Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FGD3Q5JSP0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD3Q5JSP0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms