Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PITRM1Q5JRX3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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