Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms