Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms