Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A12Q504Y0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms