Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms